Население не обеспечено доброкачественной питьевой водой, все еще высок удельный вес проб водопроводной воды, не соответствующей гигиеническим требованиям. В январе 2012 года лабораториями ФБУЗ Центр гигиены и эпидемиологии в КЧР по текущему контролю было исследовано на бактериологические показатели 44 пробы воды водопроводной, из них 19 проб по г. Карачаевску, 16 проб не соответствует гигиеническим требованиям, что составляет 36,4%, все нестандартные по бактериологическим показателям пробы были отобраны в населенных пунктах Карачаевского муниципального района. Кроме этого, 76 проб воды водопроводной исследовано на санитарно-химические показатели, из них 37 проб по г. Карачаевску, 4 пробы, которые были отобраны по г. Карачаевску, не соответствуют гигиеническим требованиям в связи с превышением количества остаточного хлора, удельный вес нестандартных проб составляет 5,3%. В январе 2013 года зарегистрировано случаев заболеваний у жителей Карачаевского городского округа и Карачаевского муниципального района, в сравнении с аналогичным периодом 2012 года:  Наименование заболеваний Карачаевский городской округ Карачаевский муниципальный район январь 2013 года январь 2012 года январь 2013 года январь 2012 года Острые кишечные инфекции с неустановленным возбудителем 61 37 29 23 Бактериальная дизентерия 0 6 1 1 ОРВИ 34 19 6 4 Пневмонии 9 6 5 4 Ветряная оспа 17 3 1 0 Микроспория 2 5 4 1 Трихофития 1 4 1 1 Заместитель начальника ОСН Управления Роспотребнадзора по КЧР Хапаев Б. А.